從DNA重組到細菌基因組計劃,從微生物代謝工程到酶工業(yè),從微生物肥料到土壤修復??梢哉f,現(xiàn)代生物技術的高速發(fā)展,離不開微生物。
“憑借著生長速度快、結(jié)構(gòu)簡單、易操作等特點,微生物學成為生物技術的基礎學科,微生物也是生物產(chǎn)業(yè)中不可替代的基本材料。”在接受《中國科學報》記者采訪時,中國微生物學會秘書長肖昌松多次強調(diào)。
人才,是近些年來我國微生物學發(fā)展的重要支撐。
據(jù)悉,目前我國單是從事微生物學的研究人員就超過了5萬名,微生物及微生物相關的國家重點實驗室有19個,國家自然科學基金委員會支持的與微生物直接相關的創(chuàng)新團隊有2個。
肖昌松表示,近幾年,我國微生物學的研究主要以應用基礎為主,圍繞有應用前景和社會需求相關的領域,進行微生物菌種改造、高產(chǎn)工程菌構(gòu)建及發(fā)酵條件優(yōu)化等研究工作。
除了基礎性研究,微生物學應用研究的涉及面也在不斷拓展,微生物技術廣泛應用于生物制藥、微生物肥料、生物質(zhì)能源、環(huán)境友好的生物質(zhì)材料、污染物的微生物降解等各個方面。
例如,作為基因工程的外源DNA載體,都是來源于微生物本身和微生物細胞中的質(zhì)粒,基因操作中被用作切割與縫合基因的數(shù)千種工具酶,也都絕大部分來自不同的微生物。
不僅如此,自遺傳工程開創(chuàng)以來,昔日由動物才能產(chǎn)生的胰島素、干擾素和白細胞介素等昂貴藥物紛紛轉(zhuǎn)向由“微生物工程菌”來生產(chǎn),與人類生殖、避孕等密切相關的激素類藥物也早已從化工生產(chǎn)方式轉(zhuǎn)向微生物生物轉(zhuǎn)化的生產(chǎn)方式。
另外,曾經(jīng)那些會造成環(huán)境惡化的各種化學肥料和化學農(nóng)藥,也逐漸被微生物肥料、微生物殺蟲劑或農(nóng)用抗生素所取代。
更加值得一提的是,隨著新一代測序技術的投入使用,基因組測序速度大大提高,全新的元基因組方法更是極大提高了人類所能接觸的微生物范圍。
肖昌松表示,越來越多的微生物將被全序列分析,運用“比較基因組”和“功能基因組學”技術闡明微生物生命活動的全貌將成為微生物學的重要發(fā)展趨勢。
工業(yè)微生物技術升溫
可以說,微生物在新興的生物技術產(chǎn)業(yè)中已經(jīng)捷足先登,特別是應用于工業(yè)生產(chǎn)中,為人類創(chuàng)造了巨大的財富。
現(xiàn)如今,微生物技術已經(jīng)滲透到醫(yī)藥、農(nóng)業(yè)、能源、精細化工、環(huán)境保護等幾乎所有的工業(yè)領域,特別是以酶工程研究為基礎的酶制劑工業(yè),已經(jīng)表現(xiàn)出良好的發(fā)展勢頭。
數(shù)據(jù)顯示,2004年,全國酶制劑產(chǎn)量為42萬噸,到2008年已增加到61.5萬噸,平均年增長率為10.1%。另外,新酶品種也在逐漸增加,雖然糖化酶、淀粉酶、蛋白酶仍保持較大份額,但植酸酶、飼用復合酶以及纖維素酶和木聚糖的酶產(chǎn)量都呈現(xiàn)出增長態(tài)勢。
然而擺在眼前的是,雖然我國酶制劑工業(yè)取得了不小的成績,但是與諾維信、杰能科等世界著名公司相比,仍然存在較大差距。
在肖昌松看來,我國目前工業(yè)酶制劑產(chǎn)品仍以傳統(tǒng)低端酶種、單酶以及固體粗酶為主,缺少精致、高端的酶制劑品種。另外,由于技術、工藝和裝備水平相對落后,基因工程技術、蛋白質(zhì)工程技術開發(fā)的酶制劑工業(yè)化生產(chǎn)遠未實現(xiàn)。
為此,肖昌松認為,新酶的發(fā)現(xiàn)是酶工程應用的物質(zhì)基礎,而自然界豐富多樣的微生物則是最重要的酶來源。特別是利用極端環(huán)境微生物產(chǎn)生的性質(zhì)穩(wěn)定的酶,將成為未來新酶研究的主要領域。
值得一提的是,由于微生物具有獨特和高效的生物轉(zhuǎn)化能力及產(chǎn)生多樣性代謝產(chǎn)物的能力,當前對重要微生物的基因組進行分析的工作正在活躍地開展。
“通過比較基因組學和生物信息學的集成,人類可以按照其意愿構(gòu)建自然界并不存在的工業(yè)微生物,生產(chǎn)出所需要的物質(zhì)?!毙げ烧f。
另外,肖昌松表示,由于微生物發(fā)酵工程具有代謝產(chǎn)物種類多、原料來源廣、能源消耗低、經(jīng)濟效益高和環(huán)境污染少等優(yōu)點,未來有望取代高溫、高壓、能耗大和“三廢”嚴重的化學工業(yè)。
進軍極端微生物
如今,微生物資源的收集已經(jīng)從傳統(tǒng)陸地土壤采樣開始向極端環(huán)境和海洋進軍。
肖昌松提供的數(shù)據(jù)顯示,在海洋微生物產(chǎn)品方面,已經(jīng)從海洋微生物中分離鑒定出1000余個活性化合物,有20余種高活性化合物可作為藥物先導化合物進行進一步的研究和開發(fā),有近10個高活性、結(jié)構(gòu)新穎的抗腫瘤、抗病毒、抗菌和免疫抑制活性的先導化合物具有良好的藥用價值。
肖昌松表示,我國未來還將重點開展海洋微生物高密度發(fā)酵技術、海洋共生微生物的共培養(yǎng)與利用技術、深海與極端微生物研究與利用技術等研究工作,進一步開拓核糖體工程、元基因組學、組合生物合成等現(xiàn)代生物技術在海洋微生物開發(fā)利用中的應用。
而在環(huán)境微生物資源方面,新極端微生物類群的培養(yǎng)技術方面更是取得了較大的進展。據(jù)介紹,目前已測序的7株環(huán)境細菌中涵蓋了嗜高溫、耐低溫、耐高壓、嗜酸等各種極端微生物。
“目前,我們主要是在進行收集更多的微生物種群、建立適合的遺傳操作系統(tǒng)、針對相關的種群進行DNA復制、基因表達調(diào)控的基礎性研究?!毙げ烧f。
肖昌松表示,未來還將開展更多極端微生物的基因組測序,同時建立新的生物技術手段,獲得重要的微生物種群和基因資源庫,進行重要產(chǎn)物的開發(fā)和利用。